Bioinformatique et Biomarqueurs
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Institute for Regenerative medicine & Biotherapy (IRMB), Inserm UMR 1183, Université de Montpellier
Hôpital Saint-Eloi
80 rue Augustin Fliche
34295 Montpellier, France
Intérêt scientifique
Le groupe bioinformatique comprend des spécialistes de l’algorithmique des textes et se concentrent sur la conception de nouveaux outils et structures pour l’analyse de séquençages haut débit d’ARN. Nous avons développé des logiciels et des structures de données pour l’analyse des données de Séquençage ARN (tels que Gk-Arrays, CRAC, CracTools, ChimCT). Récemment, nous avons créé de nouvelles stratégies basées sur des kmers capables d’organiser les séquences pour une réponse rapide à des requêtes spécifiques. Généralement silencieux, les rétrotransposons sont dérégulés dans de nombreux cancers. Nous nous intéressons au développement d’approches permettant de déchiffrer le rôle de la dérégulation épigénétique et de l’expression des rétrotransposons dans diverses leucémies myéloïdes aiguës.
Le groupe bioinformatique comprend des spécialistes de l’algorithmique des textes et se concentrent sur la conception de nouveaux outils et structures pour l’analyse de séquençages haut débit d’ARN. Nous avons développé des logiciels et des structures de données pour l’analyse des données de Séquençage ARN (tels que Gk-Arrays, CRAC, CracTools, ChimCT). Récemment, nous avons créé de nouvelles stratégies basées sur des kmers capables d’organiser les séquences pour une réponse rapide à des requêtes spécifiques. Généralement silencieux, les rétrotransposons sont dérégulés dans de nombreux cancers. Nous nous intéressons au développement d’approches permettant de déchiffrer le rôle de la dérégulation épigénétique et de l’expression des rétrotransposons dans diverses leucémies myéloïdes aiguës.
Base de données
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