Instabilités génétiques et contrôle par le génome hôte
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Institute of Genetics Reproduction and Development (iGReD), CNRS UMR6293, inserm U1103, Université Clermont Auvergne
Faculté de médecine – CRBC
28, Place Henri Dunant
63000 Clermont-Ferrand
France
Intérêt scientifique
Les génomes eucaryotes sont majoritairement composés de séquences répétées et notamment d’éléments transposables (ET), séquences d’ADN mobile hautement mutagènes constituant une menace sévère pour le maintien de l’intégrité des génomes. Les ETs résident dans le génome de toutes les espèces et occupent près de la moitié du génome humain. Le premier rempart à ériger pour contrer leur mobilisation est la protection de la lignée germinale puisque l’information génétique de ces cellules sera transmise à la descendance. Dix ans après la découverte des premiers petits ARNs non-codants, une nouvelle classe, les piARNs, a été découverte dans la lignée germinale des métazoaires y compris l’homme. Ces piARNs sont des régulateurs clés de l’expression des ETs. Pour cette raison, une mauvaise régulation de leur niveau d’expression peut entraîner l’apparition de pathologies. Malgré la distance évolutive qui sépare les drosophiles des humains, une forte conservation des réseaux moléculaires de la voie des piARNs a été démontrée. Les millions de piARNs produits par les cellules germinales proviennent de régions génomiques appelées clusters de piARNs. Ces clusters sont composés d’une multitude d’ETs et représentent le répertoire d’ETs que la cellule doit réprimer. Cependant suite à une réactivation d’ET dans un tissu somatique adjacent aux cellules germinales, certains de ces ETs sont capables d’infecter et d’envahir le génome de la lignée germinale comme le ferait un virus. L’ensemble de nos projets vise à comprendre la régulation transcriptionnelle des clusters de piARNs au cours du développement et la mise en place de la répression des ETs chez les organismes. Des approches combinées de microscopie confocale et électronique, de génétique, de génomique, d’édition du génome, de séquençages et de bio-informatique sont utilisées. Les approches originales que nous développons apporteront des réponses essentielles sur le rôle des petits ARN non-codant dans le maintien de l’intégrité des génomes.
Les génomes eucaryotes sont majoritairement composés de séquences répétées et notamment d’éléments transposables (ET), séquences d’ADN mobile hautement mutagènes constituant une menace sévère pour le maintien de l’intégrité des génomes. Les ETs résident dans le génome de toutes les espèces et occupent près de la moitié du génome humain. Le premier rempart à ériger pour contrer leur mobilisation est la protection de la lignée germinale puisque l’information génétique de ces cellules sera transmise à la descendance. Dix ans après la découverte des premiers petits ARNs non-codants, une nouvelle classe, les piARNs, a été découverte dans la lignée germinale des métazoaires y compris l’homme. Ces piARNs sont des régulateurs clés de l’expression des ETs. Pour cette raison, une mauvaise régulation de leur niveau d’expression peut entraîner l’apparition de pathologies. Malgré la distance évolutive qui sépare les drosophiles des humains, une forte conservation des réseaux moléculaires de la voie des piARNs a été démontrée. Les millions de piARNs produits par les cellules germinales proviennent de régions génomiques appelées clusters de piARNs. Ces clusters sont composés d’une multitude d’ETs et représentent le répertoire d’ETs que la cellule doit réprimer. Cependant suite à une réactivation d’ET dans un tissu somatique adjacent aux cellules germinales, certains de ces ETs sont capables d’infecter et d’envahir le génome de la lignée germinale comme le ferait un virus. L’ensemble de nos projets vise à comprendre la régulation transcriptionnelle des clusters de piARNs au cours du développement et la mise en place de la répression des ETs chez les organismes. Des approches combinées de microscopie confocale et électronique, de génétique, de génomique, d’édition du génome, de séquençages et de bio-informatique sont utilisées. Les approches originales que nous développons apporteront des réponses essentielles sur le rôle des petits ARN non-codant dans le maintien de l’intégrité des génomes.
Base de données
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