Analyse des génomes
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Unité de Recherches en Génomique-Info, INRAE UR 1164
INRAE, Centre de recherche de Versailles, bat.18
RD10, Route de Saint Cyr
78026 Versailles Cedex, FRANCE
Intérêt scientifique
Les éléments transposables (ET) sont des séquences d’ADN mobiles intragénomiques répétitives qui constituent un composant structurellement dynamique des génomes. Ils se sont avérés être les principaux contributeurs des mutations génomiques et l’un des composants quantitativement majeurs de leurs séquences (par exemple 90% du génome du blé). Il ne fait aucun doute que l’ADN génomique moderne a évolué en étroite association avec les ET, mais leur évolution à long terme et leurs effets systémiques sur l’hôte sont encore mal connus. Pour répondre à ces questions, nous développons à la fois des outils bioinformatiques et effectuons des analyses du génome pour explorer les séquences d’ADN à différentes échelles de temps, d’études pan-génomiques aux études paléogénomiques.
Les éléments transposables (ET) sont des séquences d’ADN mobiles intragénomiques répétitives qui constituent un composant structurellement dynamique des génomes. Ils se sont avérés être les principaux contributeurs des mutations génomiques et l’un des composants quantitativement majeurs de leurs séquences (par exemple 90% du génome du blé). Il ne fait aucun doute que l’ADN génomique moderne a évolué en étroite association avec les ET, mais leur évolution à long terme et leurs effets systémiques sur l’hôte sont encore mal connus. Pour répondre à ces questions, nous développons à la fois des outils bioinformatiques et effectuons des analyses du génome pour explorer les séquences d’ADN à différentes échelles de temps, d’études pan-génomiques aux études paléogénomiques.
Base de données
| Nom | Lien |
|---|
Outils Bioinfo
[{"name":"Le package REPET : annotation des répétitions dans les génomes eucaryotes","url":"https://urgi.versailles.inra.fr/Tools/REPET"},{"name":"RepetDB : Une base de données d’éléments transposables eucaryotes","url":"https://urgi.versailles.inrae.fr/repetdb/"}]
| Name | Link |
|---|---|
| Material Design Color Palette | GitHub |
| Material Design Iconic Font | Codepen |
Thematic