Dynamique des génomes et variation épigénétique (GDEV)
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Institut de Biologie de l’Ecole normale supérieure (Paris), CNRS UMR 8197, Inserm U1024
IBENS
46 rue d’Ulm
75230 Paris Cedex 05
France
Intérêt scientifique
Notre groupe étudie la contribution des éléments transposables (ET) à la création de variations phénotypiques héréditaires, à l’adaptation et à l’évolution. Nous nous intéressons particulièrement à établir l’impact des processus épigénétiques impliquant la chromatine, notamment la méthylation de l’ADN, sur différents aspects de la biologie des ET ainsi que sur le fonctionnement du génome. Nous utilisons la plante à fleurs Arabidopsis thaliana comme modèle expérimental principal et mettons en œuvre des approches avancées de génétique moléculaire ainsi que de génomique et d’épigénomique pour déterminer la distribution des ET au sein et entre génomes, les facteurs génétiques et environnementaux qui contrôlent leur mobilisation, et enfin l’effet des insertions d’ET sur les gènes avoisinants.
Notre groupe étudie la contribution des éléments transposables (ET) à la création de variations phénotypiques héréditaires, à l’adaptation et à l’évolution. Nous nous intéressons particulièrement à établir l’impact des processus épigénétiques impliquant la chromatine, notamment la méthylation de l’ADN, sur différents aspects de la biologie des ET ainsi que sur le fonctionnement du génome. Nous utilisons la plante à fleurs Arabidopsis thaliana comme modèle expérimental principal et mettons en œuvre des approches avancées de génétique moléculaire ainsi que de génomique et d’épigénomique pour déterminer la distribution des ET au sein et entre génomes, les facteurs génétiques et environnementaux qui contrôlent leur mobilisation, et enfin l’effet des insertions d’ET sur les gènes avoisinants.
Base de données
| Nom | Lien |
|---|
Outils Bioinfo
[{"name":"TE-Sequence Capture: Massively parallel experimental detection of TE mobilization events in the model plant Arabidopsis thaliana. ","url":"https://doi.org/10.1007/978-1-0716-1134-0_14"},{"name":"SPLITREADER: bioinformatic pipeline for the detection of non-reference TE sequences in re-sequenced genomes.","url":"https://doi.org/10.1007/978-1-0716-1134-0_15"}]
| Name | Link |
|---|---|
| Material Design Color Palette | GitHub |
| Material Design Iconic Font | Codepen |