Rétrotransposons et plasticité du génome
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Institute for Research on Cancer and Ageing of Nice (IRCAN), CNRS UMR 7284, Inserm U1081, Université Côte d’Azur
IRCAN – Faculté de Médecine
28, Av. Valombrose
06107 Nice Cedex 2
France
Intérêt scientifique
Les rétrotransposons sont des séquences d’ADN hautement répétées, très abondantes dans le génome humain. Ils se dispersent par un mécanisme de copier-coller, appelé rétrotransposition, via un intermédiaire ARN et une étape de transcription inverse. Ce processus peut entraîner de profonds réarrangements chromosomiques. Bien que généralement silencieux, les rétrotransposons sont exprimés et mobiles dans les cellules germinales, dans l’embryon précoce et dans les cellules souches embryonnaires, ce qui peut provoquer des maladies génétiques. Les rétrotransposons sont également massivement ré-exprimés dans la grande majorité des cancers, contribuant ainsi à la plasticité des génomes tumoraux. Notre équipe étudie les mécanismes de réactivation des rétrotransposons dans les cancers humains, leur préférence de site d’insertion et leur impact sur les gènes. Dans ce but, nous développons des approches génomiques innovantes, en combinant biochimie, biologie moléculaire et cellulaire, et bioinformatique. Comprendre comment l’activité des rétrotransposons est contrôlée améliorera notre connaissance des mécanismes qui conduisent à l’apparition de nouvelles maladies génétiques ou à la formation des cancers.
Les rétrotransposons sont des séquences d’ADN hautement répétées, très abondantes dans le génome humain. Ils se dispersent par un mécanisme de copier-coller, appelé rétrotransposition, via un intermédiaire ARN et une étape de transcription inverse. Ce processus peut entraîner de profonds réarrangements chromosomiques. Bien que généralement silencieux, les rétrotransposons sont exprimés et mobiles dans les cellules germinales, dans l’embryon précoce et dans les cellules souches embryonnaires, ce qui peut provoquer des maladies génétiques. Les rétrotransposons sont également massivement ré-exprimés dans la grande majorité des cancers, contribuant ainsi à la plasticité des génomes tumoraux. Notre équipe étudie les mécanismes de réactivation des rétrotransposons dans les cancers humains, leur préférence de site d’insertion et leur impact sur les gènes. Dans ce but, nous développons des approches génomiques innovantes, en combinant biochimie, biologie moléculaire et cellulaire, et bioinformatique. Comprendre comment l’activité des rétrotransposons est contrôlée améliorera notre connaissance des mécanismes qui conduisent à l’apparition de nouvelles maladies génétiques ou à la formation des cancers.
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