Séquence, Structure et Fonction des ARN
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Institute for Integrative Biology of the Cell (I2BC), Université Paris-Saclay, CEA
Campus du CNRS
Bâtiment 26
1, avenue de la terrasse
91190 Gif-sur-Yvette
FRANCE
Intérêt scientifique
Nous étudions la structure, fonction et évolution des introns de groupe II mobiles par une approche multidisciplinaire qui combine l’analyse phylogénétique, la biologie moléculaire et la cristallographie aux rayons X. Les introns de groupe II forment la classe la plus abondante de rétrotransposons chez les bactéries et à ce titre jouent un rôle majeur dans la diversification et l’évolution des génomes bactériens. Ces éléments sont également très répandus dans les génomes des organites (mitochondries et chloroplastes) des plantes, algues et champignons. L’intron de groupe II mobile est un élément composite formé par un grand ARN catalytique (ribozyme) très structuré et auto-épissable, interrompu par une phase ouverte de lecture codant pour une transcriptase inverse multifonctionnelle. Les activités combinées du ribozyme auto-épissable et de sa transcriptase inverse opèrent la rétrotransposition de l’élément complet de façon très efficace et site-spécifique. De façon remarquable, les caractéristiques structurales et fonctionnelles des introns de groupe II mobiles suggèrent qu’ils seraient les ancêtres des introns nucléaires, du spliceosome et des rétrotransposons non-LTR eucaryotes parmi lesquels les éléments LINE-1 qui constituent 17% du génome humain. Nous utilisons des approches génétiques, biochimiques et structurales (cristallographie aux rayons X) pour (i) caractériser la variété de stratégies moléculaires qui sous-tendent la dissémination des introns de groupe II dans les génomes et (ii) déterminer l’impact fonctionnel de ces introns dans la cellule hôte. Collectivement, ces études permettront d’approfondir notre compréhension sur le rôle des introns de groupe II dans la dynamique et évolution des génomes hôtes et contribueront à éclairer la question des liens évolutifs entre rétrotransposons procaryotes et eucaryotes.
Nous étudions la structure, fonction et évolution des introns de groupe II mobiles par une approche multidisciplinaire qui combine l’analyse phylogénétique, la biologie moléculaire et la cristallographie aux rayons X. Les introns de groupe II forment la classe la plus abondante de rétrotransposons chez les bactéries et à ce titre jouent un rôle majeur dans la diversification et l’évolution des génomes bactériens. Ces éléments sont également très répandus dans les génomes des organites (mitochondries et chloroplastes) des plantes, algues et champignons. L’intron de groupe II mobile est un élément composite formé par un grand ARN catalytique (ribozyme) très structuré et auto-épissable, interrompu par une phase ouverte de lecture codant pour une transcriptase inverse multifonctionnelle. Les activités combinées du ribozyme auto-épissable et de sa transcriptase inverse opèrent la rétrotransposition de l’élément complet de façon très efficace et site-spécifique. De façon remarquable, les caractéristiques structurales et fonctionnelles des introns de groupe II mobiles suggèrent qu’ils seraient les ancêtres des introns nucléaires, du spliceosome et des rétrotransposons non-LTR eucaryotes parmi lesquels les éléments LINE-1 qui constituent 17% du génome humain. Nous utilisons des approches génétiques, biochimiques et structurales (cristallographie aux rayons X) pour (i) caractériser la variété de stratégies moléculaires qui sous-tendent la dissémination des introns de groupe II dans les génomes et (ii) déterminer l’impact fonctionnel de ces introns dans la cellule hôte. Collectivement, ces études permettront d’approfondir notre compréhension sur le rôle des introns de groupe II dans la dynamique et évolution des génomes hôtes et contribueront à éclairer la question des liens évolutifs entre rétrotransposons procaryotes et eucaryotes.
Base de données
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